Este comité es un organismo multisectorial y multidisciplinario creado por la entonces Secretaría de Medio Ambiente y Desarrollo Sustentable de Santa Fe, hoy Ministerio, el 11 de Junio de 2003. Sus objetivos principales son:
- Elaborar un Plan de Manejo para el Sitio Ramsar Jaaukanigás, conforme a lo establecido en el artículo 3.1 de la Convención Ramsar.
- Asesorar (de manera no vinculante) al Ministerio de Medio Ambiente en distintos aspectos de conservación y manejo del Sitio Ramsar Jaaukanigás.
En una primera etapa, el CIM trabajó para la declaración de los humedales como sitio Ramsar. Una vez logrado esto en 2010, el esfuerzo estuvo puesto en la realización de un diagnóstico minucioso de su biodiversidad. Finalmente se generaron planes de manejo integrales para el área.
Finalmente se generaron planes de manejo integrales para el área.